粒子模拟方法的高性能计算

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引用格式: 严历,郭力,二维宏观拟颗粒并行模拟程序通信性能优化策略,计算机与应用化学, 2009, 26(7):833-837
标题:二维宏观拟颗粒并行模拟程序通信性能优化策略
作者: 严历; 郭力;中国科学院过程工程研究所多相复杂系统国家重点实验室:高性能计算与化学信息学课题组
关键词: 粒子模拟; 并行计算; 通信优化; 进程划分; 用户层通信协议;
摘要:随着粒子模拟并行计算在相关领域应用的不断深入和并行节点计算能力的不断增强,粒子模拟并行程序中通信耗时对整体性能的影响越来越显著,甚至成为主要性能瓶颈。本文在分析影响并行程序通信性能多种因素的基础上,从进程划分方式选择、通信协议优化的角度,对1个典型粒子模拟并行程序——二维宏观拟颗粒并行模拟程序在千兆以太网环境下的通信性能的优化策略进行了测试研究,通过改进并行进程划分方式,采用用户级通信协议等方法,使测试程序通信性能获得明显提高,进而提出了粒子模拟并行程序通信性能优化的思路和建议。